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| 12.09.2009 | 13:00 | Tulevik Viljandi | - | JK Sillamäe Kalev | 1:3 (1:1) | |
| 13:00 | FC Levadia | - | FC Kuressaare | 8:0 (2:0) | ||
| 13:00 | JK Tammeka | - | JK Tallinna Kalev | 1:0 (1:0) | ||
| 13:00 | JK Nõmme Kalju | - | FC Flora | 3:2 (2:2) | ||
| 16:00 | JK Narva Trans | - | Paide Linnameeskond | 4:1 (1:1) |
| # | Mannschaft | Sp. | S. | U. | N. | Tore | Dif. | Pk. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
|
FC Levadia | 27 | 23 | 4 | 0 | 100:18 | 82 | 73 |
| 2 |
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JK Sillamäe Kalev | 27 | 19 | 3 | 5 | 68:29 | 39 | 60 |
| 3 |
|
FC Flora | 27 | 16 | 5 | 6 | 53:24 | 29 | 53 |
| 4 |
|
JK Narva Trans | 27 | 16 | 5 | 6 | 59:24 | 35 | 53 |
| 5 |
|
JK Nõmme Kalju | 26 | 13 | 5 | 8 | 50:29 | 21 | 44 |
| 6 |
|
Tulevik Viljandi | 27 | 10 | 6 | 11 | 33:35 | -2 | 36 |
| 7 |
|
Paide Linnameeskond | 27 | 6 | 3 | 18 | 15:70 | -55 | 21 |
| 8 |
|
FC Kuressaare | 26 | 5 | 3 | 18 | 14:70 | -56 | 18 |
| 9 |
|
JK Tammeka | 27 | 4 | 2 | 21 | 19:70 | -51 | 14 |
| 10 |
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JK Tallinna Kalev | 27 | 2 | 4 | 21 | 20:62 | -42 | 10 |
| Champions League Quali. | |
| Europa League | |
| Relegation | |
| Abstieg |
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# Das Spiel FC Kuressaare - JK Nõmme Kalju (19. Spieltag) wurde vom Verband annuliert und für beide Teams mit 0 Punkten und 0 Toren gewertet, da beide nicht freigegebene Spieler eingesetzt haben. |
