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| H | Molde FK | - | Hamilton Academical | 3:0 (1:0) | ||
| R | Hamilton Academical | - | Molde FK | 4:2 (2:1) | ||
| H: 03.10.2023 11:00 | R: 24.10.2023 20:00 | Sieger: Molde FK | ||||
| H | AZ Alkmaar | - | Klaipėdos FM | 12:0 (7:0) | ||
| R | Klaipėdos FM | - | AZ Alkmaar | 0:2 (0:1) | ||
| H: 03.10.2023 17:00 | R: 25.10.2023 17:30 | Sieger: AZ Alkmaar | ||||
| H | FK Turan | - | FC Sheriff | 0:1 (0:0) | ||
| R | FC Sheriff | - | FK Turan | 5:0 (1:0) | ||
| H: 04.10.2023 12:00 | R: 25.10.2023 14:00 | Sieger: FC Sheriff | ||||
| H | Lech Poznań | - | FC Nantes | 1:1 (1:0) | ||
| R | FC Nantes | - | Lech Poznań | 4:2 (0:0, 0:0) i.E. | ||
| H: 04.10.2023 14:00 | R: 25.10.2023 17:00 | Sieger: FC Nantes | ||||
| H | Rukh Lviv | - | FK Sarajevo Academy | 1:1 (0:1) | ||
| R | FK Sarajevo Academy | - | Rukh Lviv | 1:3 (1:1) | ||
| H: 04.10.2023 14:00 | R: 25.10.2023 16:00 | Sieger: Rukh Lviv | ||||
| H | Dinamo Zagreb | - | İstanbul Başakşehir | 2:1 (0:0) | ||
| R | İstanbul Başakşehir | - | Dinamo Zagreb | 1:3 (0:1) | ||
| H: 04.10.2023 14:00 | R: 25.10.2023 13:00 | Sieger: Dinamo Zagreb | ||||
| H | Gabala FK | - | Puskás FC | 1:1 (1:1) | ||
| R | Puskás FC | - | Gabala FK | 0:1 (0:0) | ||
| H: 04.10.2023 14:00 | R: 25.10.2023 16:00 | Sieger: Gabala FK | ||||
| H | Paphos FC | - | MŠK Žilina | 0:1 (0:1) | ||
| R | MŠK Žilina | - | Paphos FC | 5:0 (1:0) | ||
| H: 04.10.2023 15:00 | R: 25.10.2023 16:30 | Sieger: MŠK Žilina | ||||
| H | AC Sparta Praha | - | Maccabi Haifa | 1:1 (0:1) | ||
| R | Maccabi Haifa | - | AC Sparta Praha | n.gesp. | ||
| H: 04.10.2023 15:00 | R: 25.10.2023 | Sieger: Maccabi Haifa | ||||
| H | FC Famalicão | - | FC Midtjylland | 2:2 (2:0) | ||
| R | FC Midtjylland | - | FC Famalicão | 7:6 (0:0, 0:0) i.E. | ||
| H: 04.10.2023 16:00 | R: 25.10.2023 15:00 | Sieger: FC Midtjylland | ||||
| H | Olympiakos Piraeus | - | US Lecce | 3:1 (1:0) | ||
| R | US Lecce | - | Olympiakos Piraeus | 1:3 (0:2) | ||
| H: 04.10.2023 16:00 | R: 25.10.2023 20:30 | Sieger: Olympiakos Piraeus | ||||
| H | Dinamo Minsk | - | PFC Ludogorets Razgrad | 0:1 (0:0) | ||
| R | PFC Ludogorets Razgrad | - | Dinamo Minsk | 0:2 (0:1) | ||
| H: 04.10.2023 17:00 | R: 08.10.2023 17:00 | Sieger: Dinamo Minsk | ||||
| H | CS Universitatea Craiova | - | Partizan | 0:1 (0:1) | ||
| R | Partizan | - | CS Universitatea Craiova | 4:0 (1:0) | ||
| H: 04.10.2023 18:00 | R: 25.10.2023 18:00 | Sieger: Partizan | ||||
| H | NK Maribor | - | 1. FSV Mainz 05 | 0:2 (0:1) | ||
| R | 1. FSV Mainz 05 | - | NK Maribor | 1:1 (0:1) | ||
| H: 04.10.2023 18:00 | R: 25.10.2023 18:30 | Sieger: 1. FSV Mainz 05 | ||||
| H | Malmö FF | - | HJK Helsinki | 1:4 (0:3) | ||
| R | HJK Helsinki | - | Malmö FF | 1:2 (0:2) | ||
| H: 04.10.2023 18:45 | R: 25.10.2023 18:00 | Sieger: HJK Helsinki | ||||
| H | KAA Gent | - | FC Basel | 0:1 (0:1) | ||
| R | FC Basel | - | KAA Gent | 2:0 (2:0) | ||
| H: 04.10.2023 19:00 | R: 25.10.2023 19:00 | Sieger: FC Basel | ||||
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# Nach dem Terrorangriff der Hamas auf Israel Anfang Oktober 2023 zog Maccabi Haifa sein team aus dem Wettbewerb zurück. |
