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| # | Mannschaft | Sp. | S. | U. | N. | Tore | Dif. | Pk. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
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Hessen Kassel | 15 | 12 | 1 | 2 | 37:9 | 28 | 37 |
| 2 |
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1. FC Heidenheim 1846 | 15 | 10 | 3 | 2 | 31:15 | 16 | 33 |
| 3 |
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SSV Ulm 1846 | 15 | 9 | 5 | 1 | 33:11 | 22 | 32 |
| 4 |
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SC Pfullendorf | 15 | 10 | 2 | 3 | 29:15 | 14 | 32 |
| 5 |
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Eintracht Frankfurt II | 15 | 9 | 4 | 2 | 25:12 | 13 | 31 |
| 6 |
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Waldhof Mannheim | 15 | 9 | 3 | 3 | 24:14 | 10 | 30 |
| 7 |
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1. FC Nürnberg II | 15 | 8 | 3 | 4 | 35:20 | 15 | 27 |
| 8 |
|
1. FC Eintracht Bamberg | 15 | 8 | 2 | 5 | 20:18 | 2 | 26 |
| 9 |
|
TSV 1860 München II | 16 | 6 | 5 | 5 | 24:18 | 6 | 23 |
| 10 |
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SpVgg Greuther Fürth II | 15 | 7 | 2 | 6 | 20:15 | 5 | 23 |
| 11 |
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SV Wehen Wiesbaden II | 15 | 6 | 3 | 6 | 17:16 | 1 | 21 |
| 12 |
|
SC Freiburg II | 15 | 6 | 2 | 7 | 22:25 | -3 | 20 |
| 13 |
|
SSV Reutlingen | 15 | 5 | 4 | 6 | 21:20 | 1 | 19 |
| 14 |
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Viktoria Aschaffenburg | 15 | 4 | 7 | 4 | 16:18 | -2 | 19 |
| 15 |
|
Karlsruher SC II | 15 | 5 | 3 | 7 | 17:28 | -11 | 18 |
| 16 |
|
SV Darmstadt 98 | 14 | 2 | 8 | 4 | 18:24 | -6 | 14 |
| 17 |
|
TSV Großbardorf | 15 | 3 | 2 | 10 | 20:42 | -22 | 11 |
| 18 |
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SpVgg Unterhaching II | 15 | 0 | 3 | 12 | 10:33 | -23 | 3 |
| Aufstieg | |
| Abstieg |
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# Das Spiel Unterhaching II - 1860 II (25. Spieltag) wurde wegen des Einsatzes eines nicht spielberechtigten Spielers mit 0:2 gewertet. # Viktoria Aschaffenburg hat aus finanziellen Gründen keine Lizenz für die Saison 2009/2010 beantragt und steht damit als Absteiger fest. |
