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| # | Mannschaft | Sp. | S. | U. | N. | Tore | Dif. | Pk. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
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1. FC Lok Leipzig | 8 | 5 | 3 | 0 | 19:6 | 13 | 18 |
| 2 |
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Bischofswerdaer FV | 9 | 5 | 3 | 1 | 15:6 | 9 | 18 |
| 3 |
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Union Sandersdorf | 7 | 5 | 1 | 1 | 16:5 | 11 | 16 |
| 4 |
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Inter Leipzig | 8 | 5 | 1 | 2 | 14:9 | 5 | 16 |
| 5 |
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FC Einheit Rudolstadt | 9 | 4 | 3 | 2 | 15:9 | 6 | 15 |
| 6 |
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Energie Cottbus II | 8 | 4 | 0 | 4 | 12:15 | -3 | 12 |
| 7 |
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VfL Halle 96 | 7 | 3 | 1 | 3 | 15:9 | 6 | 10 |
| 8 |
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FC Carl Zeiss Jena II | 7 | 3 | 1 | 3 | 17:14 | 3 | 10 |
| 9 |
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SSV Markranstädt | 7 | 3 | 1 | 3 | 12:14 | -2 | 10 |
| 10 |
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Rot-Weiß Erfurt II | 7 | 2 | 2 | 3 | 8:12 | -4 | 8 |
| 11 |
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Askania Bernburg | 9 | 1 | 4 | 4 | 9:17 | -8 | 7 |
| 12 |
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SV SCHOTT Jena | 10 | 2 | 1 | 7 | 11:23 | -12 | 7 |
| 13 |
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FSV Barleben | 7 | 1 | 1 | 5 | 7:16 | -9 | 4 |
| 14 |
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BSG Wismut Gera | 9 | 0 | 2 | 7 | 9:29 | -20 | 2 |
| 15 |
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VFC Plauen | 7 | 0 | 2 | 5 | 4:28 | -24 | 2 |
| 16 |
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FC Eisenach | 9 | 0 | 1 | 8 | 7:33 | -26 | 1 |
| Aufstieg | |
| Abstieg |
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# Rot-Weiß Erfurt II und Energie Cottbus II wurden zum Saisonende zurückgezogen. Dadurch verringerte sich die Zahl der sportlichen Absteiger. # Der FC Eisenach beantragte für die Saison 2016/2017 keine Oberligalizenz |
