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| # | Mannschaft | Sp. | S. | U. | N. | Tore | Dif. | Pk. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
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FK Atlantas | 7 | 4 | 2 | 1 | 17:9 | 8 | 14 |
| 2 |
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Zalgiris Kaunas | 7 | 4 | 2 | 1 | 10:5 | 5 | 14 |
| 3 |
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FK Ekranas | 7 | 3 | 4 | 0 | 7:2 | 5 | 13 |
| 4 |
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FK Zalgiris | 6 | 3 | 2 | 1 | 12:4 | 8 | 11 |
| 5 |
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Inkaras Kaunas | 7 | 3 | 2 | 2 | 11:9 | 2 | 11 |
| 6 |
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FK Kareda Siauliai | 6 | 3 | 1 | 2 | 10:6 | 4 | 10 |
| 7 |
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FK Nevėžis | 6 | 1 | 1 | 4 | 3:11 | -8 | 4 |
| 8 |
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Banga Gargždai | 7 | 0 | 2 | 5 | 3:12 | -9 | 2 |
| 9 |
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FK Dainava Alytus | 6 | 0 | 2 | 4 | 2:13 | -11 | 2 |
| 10 |
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Ardena Vilnius | 6 | 0 | 1 | 5 | 1:11 | -10 | 1 |
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# Banga - Ardena (03.10.1999) wurde mit 0:0 zugunsten von Banga gewertet, wobei Banga die drei Punkte zugesprochen bekam. |
