# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 FK Zalgiris, Litauen FK Zalgiris 8 6 2 0 19:4 15 22
2 FBK Kaunas, Litauen FBK Kaunas 8 6 2 0 23:3 20 20
3 FK Kareda Siauliai, Litauen FK Kareda Siauliai 7 4 3 0 16:4 12 15
4 FK Ekranas, Litauen FK Ekranas 8 4 2 2 15:7 8 13
5 FK Nevėžis, Litauen FK Nevėžis 7 4 0 3 9:8 1 12
6 Lokomotyvas Kaunas, Litauen Lokomotyvas Kaunas 7 3 0 4 6:10 -4 9
7 Inkaras Kaunas, Litauen Inkaras Kaunas 8 2 2 4 6:9 -3 8
8 FK Banga Gargždai, Litauen FK Banga Gargždai 7 2 2 3 4:7 -3 8
9 FK Atlantas, Litauen FK Atlantas 8 2 2 4 5:12 -7 8
10 Kauno Jegeriai, Litauen Kauno Jegeriai 7 2 1 4 5:11 -6 7
11 FK Žalgiris B, Litauen FK Žalgiris B 7 2 0 5 5:13 -8 6
12 FK Dainava Alytus, Litauen FK Dainava Alytus 7 2 0 5 9:26 -17 6
13 Mastis Telšiai, Litauen Mastis Telšiai 7 1 0 6 3:11 -8 3
14 FK Panerys, Litauen FK Panerys 0 0 0 0 0:0 0 0

# Ekranas - Zalgiris (26.05.1999) wurde mit 0:0 zugunsten von Zalgiris gewertet, wobei Zalgiris die drei Punkte zugesporechen wurden (ursprünglich 1:0 für Ekranas)

# Nach dem 6. Spieltag zog Panerys Vilnius sein Team zurück. Alle Partien wurden annulliert.

# Nach dem 13. Spieltag zog Mastis Telsiai seine Mannschaft zurück. Alle bis dahin gespielten Partien behielten ihre Gültigkeit.

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