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| # | Mannschaft | Sp. | S. | U. | N. | Tore | Dif. | Pk. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
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SV Wehen Wiesbaden | 29 | 16 | 7 | 6 | 35:15 | 20 | 55 |
| 2 |
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SC Paderborn 07 | 29 | 13 | 9 | 7 | 32:18 | 14 | 48 |
| 3 |
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Karlsruher SC | 29 | 13 | 9 | 7 | 21:11 | 10 | 48 |
| 4 |
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Fortuna Köln | 29 | 13 | 8 | 8 | 24:14 | 10 | 47 |
| 5 |
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Würzburger Kickers | 29 | 12 | 10 | 7 | 26:23 | 3 | 46 |
| 6 |
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SpVgg Unterhaching | 29 | 12 | 8 | 9 | 25:23 | 2 | 44 |
| 7 |
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1. FC Magdeburg | 29 | 10 | 12 | 7 | 19:13 | 6 | 42 |
| 8 |
|
Hansa Rostock | 29 | 11 | 9 | 9 | 21:18 | 3 | 42 |
| 9 |
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SG Sonnenhof Großaspach | 29 | 11 | 9 | 9 | 22:20 | 2 | 42 |
| 10 |
|
Hallescher FC | 29 | 12 | 4 | 13 | 21:23 | -2 | 40 |
| 11 |
|
Preußen Münster | 29 | 9 | 9 | 11 | 20:17 | 3 | 36 |
| 12 |
|
SV Meppen | 29 | 9 | 9 | 11 | 18:21 | -3 | 36 |
| 13 |
|
VfL Osnabrück | 29 | 8 | 11 | 10 | 22:23 | -1 | 35 |
| 14 |
|
FSV Zwickau | 29 | 8 | 11 | 10 | 13:19 | -6 | 35 |
| 15 |
|
VfR Aalen | 29 | 8 | 10 | 11 | 21:25 | -4 | 34 |
| 16 |
|
Sportfreunde Lotte | 29 | 8 | 10 | 11 | 17:22 | -5 | 34 |
| 17 |
|
FC Carl Zeiss Jena | 29 | 8 | 9 | 12 | 16:24 | -8 | 33 |
| 18 |
|
Chemnitzer FC | 29 | 7 | 10 | 12 | 19:36 | -17 | 31 |
| 19 |
|
Werder Bremen II | 29 | 4 | 13 | 12 | 13:27 | -14 | 25 |
| 20 |
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Rot-Weiß Erfurt | 29 | 4 | 11 | 14 | 13:26 | -13 | 23 |
| Aufstieg | |
| Relegation | |
| Abstieg |
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# Rot-Weiß Erfurt wurde nach Eröffnung des Insolvenzverfahrens mit einem Abzug von neun Punkten belegt. Ein weiterer Punkt wurde RWE wegen eines Verstoßes gegen Zulassungsauflagen abgezogen. # Der Chemnitzer FC wurde nach Eröffnung des Insolvenzverfahrens mit einem Abzug von neun Punkten belegt. |
