6. Spieltag | 26.09.1999 | Waldhof Mannheim | - | FC St. Pauli | 1:3 | ||||
7. Spieltag | 01.10.1999 | FC St. Pauli | - | Kickers Offenbach | 1:1 | ||||
8. Spieltag | 15.10.1999 | Fortuna Köln | - | FC St. Pauli | 2:0 | ||||
10. Spieltag | 29.10.1999 | 1. FC Nürnberg | - | FC St. Pauli | 2:2 | ||||
11. Spieltag | 05.11.1999 | FC St. Pauli | - | Chemnitzer FC | 0:0 | ||||
12. Spieltag | 19.11.1999 | Hannover 96 | - | FC St. Pauli | 1:2 | ||||
13. Spieltag | 28.11.1999 | FC St. Pauli | - | Karlsruher SC | 3:1 | ||||
15. Spieltag | 12.12.1999 | FC St. Pauli | - | Energie Cottbus | 1:0 | ||||
16. Spieltag | 15.12.1999 | FC St. Pauli | - | 1. FC Köln | 1:2 | ||||
17. Spieltag | 19.12.1999 | Rot-Weiß Oberhausen | - | FC St. Pauli | 2:2 | ||||
19. Spieltag | 20.02.2000 | FC St. Pauli | - | Stuttgarter Kickers | 2:1 | ||||
20. Spieltag | 25.02.2000 | VfL Bochum | - | FC St. Pauli | 2:0 | ||||
21. Spieltag | 05.03.2000 | FC St. Pauli | - | TeBe Berlin | 1:1 | ||||
22. Spieltag | 10.03.2000 | Bor. Mönchengladbach | - | FC St. Pauli | 2:1 | ||||
31. Spieltag | 12.05.2000 | FC St. Pauli | - | Alemannia Aachen | 2:1 |