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| H | FK Ventspils | - | Amica Wronki | 1:1 (0:1) | ||
| R | Amica Wronki | - | FK Ventspils | 1:0 (1:0) | ||
| H: 16.09.2004 15:30 | R: 30.09.2004 18:30 | Sieger: Amica Wronki | ||||
| H | Terek Grozny | - | FC Basel 1893 | 1:1 (1:0) | ||
| R | FC Basel 1893 | - | Terek Grozny | 2:0 (1:0) | ||
| H: 16.09.2004 16:00 | R: 30.09.2004 20:15 | Sieger: FC Basel 1893 | ||||
| H | Wisła Kraków | - | Dinamo Tbilisi | 4:3 (0:2) | ||
| R | Dinamo Tbilisi | - | Wisła Kraków | 2:1 (0:0) | ||
| H: 16.09.2004 17:00 | R: 30.09.2004 17:00 | Sieger: Dinamo Tbilisi | ||||
| H | Maccabi Haifa | - | Dnipro Dnipropetrovsk | 1:0 (1:0) | ||
| R | Dnipro Dnipropetrovsk | - | Maccabi Haifa | 2:0 (1:0) | ||
| H: 16.09.2004 17:00 | R: 30.09.2004 18:00 | Sieger: Dnipro Dnipropetrovsk | ||||
| H | Zenit St. Petersburg | - | Crvena Zvezda | 4:0 (3:0) | ||
| R | Crvena Zvezda | - | Zenit St. Petersburg | 1:2 (1:0) | ||
| H: 16.09.2004 18:00 | R: 30.09.2004 19:30 | Sieger: Zenit St. Petersburg | ||||
| H | FC Schalke 04 | - | FK Liepājas Metalurgs | 5:1 (1:1) | ||
| R | FK Liepājas Metalurgs | - | FC Schalke 04 | 0:4 (0:1) | ||
| H: 16.09.2004 18:15 | R: 30.09.2004 16:00 | Sieger: FC Schalke 04 | ||||
| H | ND Gorica | - | AEK Athen | 1:1 (1:1) | ||
| R | AEK Athen | - | ND Gorica | 1:0 (0:0) | ||
| H: 16.09.2004 18:30 | R: 30.09.2004 20:30 | Sieger: AEK Athen | ||||
| H | Levski Sofia | - | KSK Beveren | 1:1 (0:0) | ||
| R | KSK Beveren | - | Levski Sofia | 1:0 (1:0) | ||
| H: 16.09.2004 18:30 | R: 30.09.2004 20:30 | Sieger: KSK Beveren | ||||
| H | Metalurh Donetsk | - | Lazio Roma | 0:3 (0:0) | ||
| R | Lazio Roma | - | Metalurh Donetsk | 3:0 (3:0) | ||
| H: 16.09.2004 19:00 | R: 30.09.2004 21:00 | Sieger: Lazio Roma | ||||
| H | FC Steaua Bucureşti | - | CSKA Sofia | 2:1 (1:1) | ||
| R | CSKA Sofia | - | FC Steaua Bucureşti | 2:2 (1:2) | ||
| H: 16.09.2004 19:00 | R: 30.09.2004 16:00 | Sieger: FC Steaua Bucureşti | ||||
| H | Odd Grenland | - | Feyenoord | 0:1 (0:0) | ||
| R | Feyenoord | - | Odd Grenland | 4:1 (2:0) | ||
| H: 16.09.2004 19:00 | R: 30.09.2004 20:30 | Sieger: Feyenoord | ||||
| H | Aalborg BK | - | AJ Auxerre | 1:1 (1:1) | ||
| R | AJ Auxerre | - | Aalborg BK | 2:0 (1:0) | ||
| H: 16.09.2004 19:00 | R: 30.09.2004 20:45 | Sieger: AJ Auxerre | ||||
| H | Trabzonspor | - | Athletic Club | 3:2 (2:0) | ||
| R | Athletic Club | - | Trabzonspor | 2:0 (1:0) | ||
| H: 16.09.2004 19:00 | R: 30.09.2004 21:30 | Sieger: Athletic Club | ||||
| H | Grazer AK | - | PFC Litex Lovech | 5:0 (3:0) | ||
| R | PFC Litex Lovech | - | Grazer AK | 1:0 (0:0) | ||
| H: 16.09.2004 19:00 | R: 30.09.2004 19:00 | Sieger: Grazer AK | ||||
| H | FC Utrecht | - | Djurgårdens IF | 4:0 (2:0) | ||
| R | Djurgårdens IF | - | FC Utrecht | 3:0 (2:0) | ||
| H: 16.09.2004 19:30 | R: 30.09.2004 20:15 | Sieger: FC Utrecht | ||||
| H | AO Egaleo | - | Gençlerbirliği | 1:0 (1:0) | ||
| R | Gençlerbirliği | - | AO Egaleo | 1:1 (0:1) | ||
| H: 16.09.2004 19:30 | R: 30.09.2004 17:00 | Sieger: AO Egaleo | ||||
| H | Shelbourne FC | - | Lille OSC | 2:2 (0:2) | ||
| R | Lille OSC | - | Shelbourne FC | 2:0 (2:0) | ||
| H: 16.09.2004 20:00 | R: 30.09.2004 19:30 | Sieger: Lille OSC | ||||
| H | Partizan | - | Dinamo Bucureşti | 3:1 (0:1) | ||
| R | Dinamo Bucureşti | - | Partizan | 0:0 (0:0) | ||
| H: 16.09.2004 20:00 | R: 30.09.2004 19:00 | Sieger: Partizan | ||||
| H | Panionios GSS | - | Udinese Calcio | 3:1 (2:1) | ||
| R | Udinese Calcio | - | Panionios GSS | 1:0 (0:0) | ||
| H: 16.09.2004 20:00 | R: 30.09.2004 21:00 | Sieger: Panionios GSS | ||||
| H | Dinamo Zagreb | - | IF Elfsborg | 2:0 (1:0) | ||
| R | IF Elfsborg | - | Dinamo Zagreb | 0:0 (0:0) | ||
| H: 16.09.2004 20:15 | R: 30.09.2004 20:15 | Sieger: Dinamo Zagreb | ||||
| H | Hammarby IF | - | Villarreal CF | 1:2 (1:2) | ||
| R | Villarreal CF | - | Hammarby IF | 3:0 (1:0) | ||
| H: 16.09.2004 20:15 | R: 30.09.2004 22:00 | Sieger: Villarreal CF | ||||
| H | FK Dukla Banská Bystrica | - | SL Benfica | 0:3 (0:1) | ||
| R | SL Benfica | - | FK Dukla Banská Bystrica | 2:0 (2:0) | ||
| H: 16.09.2004 20:30 | R: 30.09.2004 21:00 | Sieger: SL Benfica | ||||
| H | Standard Liège | - | VfL Bochum | 0:0 (0:0) | ||
| R | VfL Bochum | - | Standard Liège | 1:1 (1:0) | ||
| H: 16.09.2004 20:30 | R: 30.09.2004 20:30 | Sieger: Standard Liège | ||||
| H | Újpest FC | - | VfB Stuttgart | 1:3 (0:2) | ||
| R | VfB Stuttgart | - | Újpest FC | 4:0 (1:0) | ||
| H: 16.09.2004 20:30 | R: 30.09.2004 18:00 | Sieger: VfB Stuttgart | ||||
| H | Club Brugge KV | - | LB Châteauroux | 4:0 (2:0) | ||
| R | LB Châteauroux | - | Club Brugge KV | 1:2 (1:2) | ||
| H: 16.09.2004 20:30 | R: 30.09.2004 20:30 | Sieger: Club Brugge KV | ||||
| H | FC Sochaux | - | Stabæk IF | 4:0 (1:0) | ||
| R | Stabæk IF | - | FC Sochaux | 0:5 (0:2) | ||
| H: 16.09.2004 20:30 | R: 30.09.2004 19:00 | Sieger: FC Sochaux | ||||
| H | Heart of Midlothian | - | Sporting Braga | 3:1 (0:0) | ||
| R | Sporting Braga | - | Heart of Midlothian | 2:2 (1:1) | ||
| H: 16.09.2004 20:45 | R: 30.09.2004 19:30 | Sieger: Heart of Midlothian | ||||
| H | Austria Wien | - | Legia Warszawa | 1:0 (0:0) | ||
| R | Legia Warszawa | - | Austria Wien | 1:3 (0:2) | ||
| H: 16.09.2004 20:45 | R: 30.09.2004 20:45 | Sieger: Austria Wien | ||||
| H | Parma FC | - | NK Maribor | 3:2 (2:1) | ||
| R | NK Maribor | - | Parma FC | 0:0 (0:0) | ||
| H: 16.09.2004 20:45 | R: 30.09.2004 20:15 | Sieger: Parma FC | ||||
| H | Newcastle United | - | Bnei Sachnin FC | 2:0 (2:0) | ||
| R | Bnei Sachnin FC | - | Newcastle United | 1:5 (1:3) | ||
| H: 16.09.2004 20:45 | R: 30.09.2004 20:45 | Sieger: Newcastle United | ||||
| H | Millwall FC | - | Ferencvárosi TC | 1:1 (0:0) | ||
| R | Ferencvárosi TC | - | Millwall FC | 3:1 (3:1) | ||
| H: 16.09.2004 20:45 | R: 30.09.2004 21:00 | Sieger: Ferencvárosi TC | ||||
| H | FK Bodø/Glimt | - | Beşiktaş | 1:1 (1:0) | ||
| R | Beşiktaş | - | FK Bodø/Glimt | 1:0 (1:0) | ||
| H: 16.09.2004 21:00 | R: 30.09.2004 19:30 | Sieger: Beşiktaş | ||||
| H | Real Zaragoza | - | Sigma Olomouc | 1:0 (0:0) | ||
| R | Sigma Olomouc | - | Real Zaragoza | 2:3 (1:0) | ||
| H: 16.09.2004 21:00 | R: 30.09.2004 19:00 | Sieger: Real Zaragoza | ||||
| H | Sevilla FC | - | CD Nacional | 2:0 (1:0) | ||
| R | CD Nacional | - | Sevilla FC | 1:2 (0:1) | ||
| H: 16.09.2004 21:00 | R: 30.09.2004 21:00 | Sieger: Sevilla FC | ||||
| H | Middlesbrough FC | - | Baník Ostrava | 3:0 (0:0) | ||
| R | Baník Ostrava | - | Middlesbrough FC | 1:1 (1:0) | ||
| H: 16.09.2004 21:00 | R: 30.09.2004 20:45 | Sieger: Middlesbrough FC | ||||
| H | PAOK Saloniki | - | AZ Alkmaar | 2:3 (2:2) | ||
| R | AZ Alkmaar | - | PAOK Saloniki | 2:1 (1:1) | ||
| H: 16.09.2004 21:00 | R: 30.09.2004 20:00 | Sieger: AZ Alkmaar | ||||
| H | CS Marítimo | - | Rangers FC | 1:0 (1:0) | ||
| R | Rangers FC | - | CS Marítimo | 4:2 (0:0, 1:0, 1:0) i.E. | ||
| H: 16.09.2004 21:00 | R: 30.09.2004 21:00 | Sieger: Rangers FC | ||||
| H | Sporting CP | - | Rapid Wien | 2:0 (0:0) | ||
| R | Rapid Wien | - | Sporting CP | 0:0 (0:0) | ||
| H: 16.09.2004 22:30 | R: 30.09.2004 20:45 | Sieger: Sporting CP | ||||
| H | FH Hafnarfjörður | - | Alemannia Aachen | 1:5 (0:3) | ||
| R | Alemannia Aachen | - | FH Hafnarfjörður | 0:0 (0:0) | ||
| H: 16.09.2004 22:30 | R: 30.09.2004 20:00 | Sieger: Alemannia Aachen | ||||
| H | Maccabi Petach-Tikva | - | sc Heerenveen | n.gesp. | ||
| R | sc Heerenveen | - | Maccabi Petach-Tikva | 5:0 (2:0) | ||
| H: 23.09.2004 | R: 30.09.2004 18:00 | Sieger: sc Heerenveen | ||||
