| 27. Spieltag | 23.01.2007 | Swansea City | - | Gillingham FC | 2:0 | ||||
| 30. Spieltag | 26.01.2007 | Gillingham FC | - | Tranmere Rovers | 2:0 | ||||
| 31. Spieltag | 03.02.2007 | Huddersfield Town | - | Gillingham FC | 3:1 | ||||
| 32. Spieltag | 10.02.2007 | Gillingham FC | - | Bradford City | 1:0 | ||||
| 33. Spieltag | 16.02.2007 | Northampton Town | - | Gillingham FC | 1:1 | ||||
| 34. Spieltag | 20.02.2007 | Gillingham FC | - | Brighton & Hove Albion | 0:1 | ||||
| 35. Spieltag | 24.02.2007 | Scunthorpe United | - | Gillingham FC | 3:1 | ||||
| 36. Spieltag | 03.03.2007 | Gillingham FC | - | Blackpool FC | 2:2 | ||||
| 37. Spieltag | 10.03.2007 | Gillingham FC | - | Crewe Alexandra | 1:0 | ||||
| 38. Spieltag | 17.03.2007 | Nottingham Forest | - | Gillingham FC | 1:0 | ||||
| 39. Spieltag | 24.03.2007 | Carlisle United | - | Gillingham FC | 5:0 | ||||
| 40. Spieltag | 31.03.2007 | Gillingham FC | - | Brentford FC | 2:1 |  |
|||
| 42. Spieltag | 09.04.2007 | Gillingham FC | - | Bristol City | 1:0 | ||||
| 43. Spieltag | 14.04.2007 | Chesterfield FC | - | Gillingham FC | 0:1 |
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