| 15. Spieltag | 16.01.1999 | Apollon Smyrnis | - | Ethnikos Piraeus | 4:0 | ||||
| 16. Spieltag | 23.01.1999 | Ethnikos Piraeus | - | Panelefsiniakos Elefsinas | 2:2 |  |
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| 17. Spieltag | 30.01.1999 | Veria FC | - | Ethnikos Piraeus | 4:3 | ||||
| 18. Spieltag | 07.02.1999 | Ethnikos Piraeus | - | OFI Heraklion | 1:3 | ||||
| 19. Spieltag | 14.02.1999 | Ethnikos Piraeus | - | Paniliakos Pyrgos | 1:1 | ||||
| 20. Spieltag | 21.02.1999 | AO Proodeftiki | - | Ethnikos Piraeus | 0:0 | ||||
| 21. Spieltag | 28.02.1999 | Ethnikos Piraeus | - | Ethnikos Asteras | 1:2 | |
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| 22. Spieltag | 07.03.1999 | PAOK Saloniki | - | Ethnikos Piraeus | 0:0 |  |
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| 23. Spieltag | 14.03.1999 | Ethnikos Piraeus | - | Ionikos Nikea | 1:2 | |
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