| 27. Spieltag | 20.02.2000 | CD Logroñés | - | CP Mérida | 1:2 | ||||
| 28. Spieltag | 27.02.2000 | CP Mérida | - | UE Lleida | 0:0 | ||||
| 29. Spieltag | 05.03.2000 | UD Salamanca | - | CP Mérida | 0:0 | ||||
| 30. Spieltag | 11.03.2000 | CP Mérida | - | Albacete | 1:1 | ||||
| 31. Spieltag | 19.03.2000 | CD Badajoz | - | CP Mérida | 0:3 | ||||
| 32. Spieltag | 26.03.2000 | CP Mérida | - | Getafe CF | 1:0 | ||||
| 33. Spieltag | 02.04.2000 | SD Eibar | - | CP Mérida | 0:0 | ||||
| 34. Spieltag | 09.04.2000 | CP Mérida | - | Elche CF | 1:1 | ||||
| 35. Spieltag | 16.04.2000 | Villarreal CF | - | CP Mérida | 1:0 | ||||
| 36. Spieltag | 22.04.2000 | CP Mérida | - | Levante UD | 1:0 | ||||
| 37. Spieltag | 30.04.2000 | CD Tenerife | - | CP Mérida | 0:1 | ||||
| 38. Spieltag | 07.05.2000 | CP Mérida | - | Sporting Gijón | 1:0 | ||||
| 39. Spieltag | 14.05.2000 | Recreativo Huelva | - | CP Mérida | 0:3 | ||||
| 40. Spieltag | 21.05.2000 | CP Mérida | - | CD Toledo | 1:1 | ||||
| 41. Spieltag | 28.05.2000 | CP Mérida | - | CF Extremadura | 1:0 | ||||
| 42. Spieltag | 04.06.2000 | Atlético Madrid B | - | CP Mérida | 0:0 |
São Tomé und Príncipe
