| 30. Spieltag | 07.02.2004 | Southend United | - | Cambridge United | 1:0 |  |
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| 31. Spieltag | 14.02.2004 | Southend United | - | Kidderminster Harriers | 3:0 | ||||
| 32. Spieltag | 21.02.2004 | Leyton Orient | - | Southend United | 2:1 | |
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| 29. Spieltag | 24.02.2004 | Bury FC | - | Southend United | 1:1 | ||||
| 33. Spieltag | 28.02.2004 | Southend United | - | Macclesfield Town | 1:0 | |
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| 34. Spieltag | 03.03.2004 | Boston United | - | Southend United | 0:2 | ||||
| 35. Spieltag | 06.03.2004 | Bristol Rovers | - | Southend United | 1:1 | ||||
| 36. Spieltag | 13.03.2004 | Southend United | - | Swansea City | 1:1 | |
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| 37. Spieltag | 16.03.2004 | Lincoln City | - | Southend United | 2:2 | ||||
| 38. Spieltag | 20.04.2004 | Southend United | - | Hull City | 2:2 |  |
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| 44. Spieltag | 24.04.2004 | Southend United | - | Yeovil Town | 0:2 | ||||
| 45. Spieltag | 01.05.2004 | Rochdale AFC | - | Southend United | 1:1 | ||||
| 46. Spieltag | 08.05.2004 | Southend United | - | Torquay United | 1:2 | |
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