| 1. Spieltag | 06.08.2016 | Northampton Town | - | Fleetwood Town | 1:1 | ||||
| 2. Spieltag | 13.08.2016 | Fleetwood Town | - | Scunthorpe United | 2:2 | ||||
| 3. Spieltag | 17.08.2016 | Fleetwood Town | - | Oxford United | 2:0 | ||||
| 4. Spieltag | 20.08.2016 | Bolton Wanderers | - | Fleetwood Town | 2:1 | ||||
| 5. Spieltag | 27.08.2016 | Southend United | - | Fleetwood Town | 0:2 |  |
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| 6. Spieltag | 03.09.2016 | Fleetwood Town | - | Coventry City | 2:0 | ||||
| 7. Spieltag | 10.09.2016 | Fleetwood Town | - | Charlton Athletic | 2:2 | ||||
| 9. Spieltag | 24.09.2016 | Fleetwood Town | - | Milton Keynes Dons | 1:4 | ||||
| 10. Spieltag | 27.09.2016 | Bradford City | - | Fleetwood Town | 2:1 | ||||
| 11. Spieltag | 01.10.2016 | Fleetwood Town | - | Sheffield United | 1:1 | ||||
| 13. Spieltag | 15.10.2016 | Fleetwood Town | - | Peterborough United | 2:0 |  |
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| 14. Spieltag | 18.10.2016 | Chesterfield FC | - | Fleetwood Town | 0:1 | ||||
| 15. Spieltag | 22.10.2016 | Millwall FC | - | Fleetwood Town | 2:1 | |
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| 16. Spieltag | 29.10.2016 | Fleetwood Town | - | Gillingham FC | 2:1 | ||||
| 12. Spieltag | 01.11.2016 | Bristol Rovers | - | Fleetwood Town | 2:1 | ||||
| 17. Spieltag | 12.11.2016 | Port Vale FC | - | Fleetwood Town | 2:1 |
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