| 16. Spieltag | 15.11.2008 | Hartlepool United | - | Milton Keynes Dons | 1:3 |  |
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| 22. Spieltag | 26.12.2008 | Bristol Rovers | - | Milton Keynes Dons | 1:2 | ||||
| 23. Spieltag | 28.12.2008 | Milton Keynes Dons | - | Southend United | 2:0 |  |
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| 28. Spieltag | 27.01.2009 | Milton Keynes Dons | - | Leyton Orient | 1:2 | ||||
| 30. Spieltag | 03.02.2009 | Stockport County | - | Milton Keynes Dons | 0:1 | ||||
| 36. Spieltag | 07.03.2009 | Swindon Town | - | Milton Keynes Dons | 1:1 | |
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| 27. Spieltag | 17.03.2009 | Milton Keynes Dons | - | Millwall FC | 0:1 |
England