| 31. Spieltag | 04.02.2013 | Gillingham FC | - | Wycombe Wanderers | 0:1 | ||||
| 32. Spieltag | 09.02.2013 | Bradford City | - | Gillingham FC | 0:1 | ||||
| 23. Spieltag | 12.02.2013 | York City | - | Gillingham FC | 0:0 | ||||
| 33. Spieltag | 16.02.2013 | Gillingham FC | - | Dagenham & Redbridge | 2:1 | ||||
| 34. Spieltag | 23.02.2013 | Chesterfield FC | - | Gillingham FC | 0:1 | ||||
| 35. Spieltag | 26.02.2013 | Gillingham FC | - | Oxford United | 0:1 | ||||
| 36. Spieltag | 02.03.2013 | Aldershot Town | - | Gillingham FC | 1:1 |  |
|||
| 37. Spieltag | 09.03.2013 | Gillingham FC | - | Plymouth Argyle | 2:1 | ||||
| 38. Spieltag | 12.03.2013 | Exeter City | - | Gillingham FC | 0:0 | ||||
| 39. Spieltag | 16.03.2013 | Morecambe FC | - | Gillingham FC | 1:1 | ||||
| 29. Spieltag | 19.03.2013 | Rochdale AFC | - | Gillingham FC | 1:1 | ||||
| 40. Spieltag | 23.03.2013 | Gillingham FC | - | Accrington Stanley | 1:0 | ||||
| 41. Spieltag | 30.03.2013 | Fleetwood Town | - | Gillingham FC | 2:2 | ||||
| 42. Spieltag | 01.04.2013 | Gillingham FC | - | Rotherham United | 1:0 |
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