| Champions League Qual. | Sp. | S | U | N | Tore | |||
| Zu Hause | 1 | 0 | 1 | 0 | 0 | : | 0 | |
| Auswärts | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | : | 1 | |
| ∑ | 2 | 0 | 1 | 1 | 0 | : | 1 | |
| Europa League Qual. | Sp. | S | U | N | Tore | |||
| Zu Hause | 1 | 1 | 0 | 0 | 2 | : | 0 | |
| Auswärts | 1 | 0 | 0 | 1 | 0 | : | 5 | |
| ∑ | 2 | 1 | 0 | 1 | 2 | : | 5 | |
| GESAMT | Sp. | S | U | N | Tore | |||
| Zu Hause | 2 | 1 | 1 | 0 | 2 | : | 0 | |
| Auswärts | 2 | 0 | 0 | 2 | 0 | : | 6 | |
| Neutraler Ort | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | : | 0 | |
| ∑ | 4 | 1 | 1 | 2 | 2 | : | 6 | |
| Champions League Qual. | |||||
| 2002/2003 | 1. Runde | APOEL Nikosia | - | FC Flora | 1:0 (0:0) |
| 2002/2003 | 1. Runde | FC Flora | - | APOEL Nikosia | 0:0 (0:0) |
| Europa League Qual. | |||||
| 2018/2019 | 2. Runde | FC Flora | - | APOEL Nikosia | 2:0 (2:0) |
| 2018/2019 | 2. Runde | APOEL Nikosia | - | FC Flora | 5:0 (2:0) |
|
Für Spiele, die im Elfmeterschießen entschieden wurden, geht der Spielstand nach 120 Minuten in diese Wertung ein. |
Estland 
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