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| 07.10.2016 | 19:00 | Bayern München II | - | FC Augsburg II | 0:0 (0:0) | |
| 19:30 | FC Memmingen | - | 1. FC Schweinfurt 05 | 2:1 (1:0) | ||
| 08.10.2016 | 13:00 | VfR Garching | - | 1. FC Nürnberg II | 3:4 (1:2) | |
| 14:00 | SpVgg Bayreuth | - | Wacker Burghausen | 1:3 (0:2) | ||
| 14:00 | FC Ingolstadt 04 II | - | TSV Buchbach | 1:2 (1:1) | ||
| 14:00 | SpVgg Unterhaching | - | SpVgg Bayern Hof | 4:1 (4:0) | ||
| 14:00 | SpVgg Greuther Fürth II | - | SV Schalding-Heining | 2:1 (1:1) | ||
| 14:00 | TSV 1860 Rosenheim | - | FV Illertissen | 0:1 (0:0) | ||
| 14:00 | TSV 1860 München II | - | SV Seligenporten | 1:1 (0:1) |
| » Tabelle | Heim | Auswärts | Hinrunde | Rückrunde | 1. Halbzeit | 2. Halbzeit |
| # | Mannschaft | Sp. | S. | U. | N. | Tore | Dif. | Pk. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
|
SpVgg Unterhaching | 14 | 12 | 2 | 0 | 41:8 | 33 | 38 |
| 2 |
|
Bayern München II | 14 | 6 | 6 | 2 | 19:13 | 6 | 24 |
| 3 |
|
1. FC Nürnberg II | 14 | 7 | 3 | 4 | 33:28 | 5 | 24 |
| 4 |
|
VfR Garching | 14 | 7 | 2 | 5 | 28:25 | 3 | 23 |
| 5 |
|
FC Augsburg II | 14 | 5 | 7 | 2 | 29:17 | 12 | 22 |
| 6 |
|
FC Memmingen | 14 | 5 | 5 | 4 | 26:20 | 6 | 20 |
| 7 |
|
FV Illertissen | 14 | 6 | 2 | 6 | 20:24 | -4 | 20 |
| 8 |
|
SpVgg Greuther Fürth II | 14 | 5 | 4 | 5 | 22:19 | 3 | 19 |
| 9 |
|
SpVgg Bayreuth | 14 | 5 | 3 | 6 | 26:26 | 0 | 18 |
| 10 |
|
Wacker Burghausen | 14 | 4 | 5 | 5 | 22:24 | -2 | 17 |
| 11 |
|
TSV 1860 Rosenheim | 14 | 5 | 2 | 7 | 15:19 | -4 | 17 |
| 12 |
|
1. FC Schweinfurt 05 | 14 | 5 | 2 | 7 | 21:28 | -7 | 17 |
| 13 |
|
FC Ingolstadt 04 II | 14 | 3 | 6 | 5 | 22:26 | -4 | 15 |
| 14 |
|
TSV Buchbach | 14 | 4 | 3 | 7 | 18:25 | -7 | 15 |
| 15 |
|
SV Seligenporten | 14 | 4 | 3 | 7 | 19:36 | -17 | 15 |
| 16 |
|
SV Schalding-Heining | 14 | 2 | 5 | 7 | 20:24 | -4 | 11 |
| 17 |
|
SpVgg Bayern Hof | 14 | 2 | 1 | 11 | 17:37 | -20 | 7 |
| 18 |
|
TSV 1860 München II | 14 | 7 | 3 | 4 | 0:0 | -9 | -39 |
| Playoffs | |
| Relegation | |
| Abstieg |
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# Der TSV 1860 München II steigt gemäß den Statuten des Verbands automatisch in die Bayernliga ab, da die Profimannschaft des Vereins aus der 2. Bundesliga absteigt. Der SV Seligenporten vermeidet damit den direkten Abstieg und spielt in der Relegation, Schalding-Heining ist gerettet. |
