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| H | PAS Giannina | - | Olympiakos Piraeus | 2:0 | ||
| R | Olympiakos Piraeus | - | PAS Giannina | 2:1 n.V. | ||
| H: 17.01.2007 15:00 | R: 31.01.2007 17:45 | Sieger: PAS Giannina | ||||
| H | Ilisiakos | - | Skoda Xanthi | 0:2 | ||
| R | Skoda Xanthi | - | Ilisiakos | 1:0 | ||
| H: 17.01.2007 17:00 | R: 31.01.2007 15:00 | Sieger: Skoda Xanthi | ||||
| H | PAOK Saloniki | - | Panathinaikos | 2:1 | ||
| R | Panathinaikos | - | PAOK Saloniki | 3:1 n.V. | ||
| H: 17.01.2007 18:00 | R: 31.01.2007 20:45 | Sieger: Panathinaikos | ||||
| H | AO Kerkyra | - | AE Lárissa | 0:0 | ||
| R | AE Lárissa | - | AO Kerkyra | 2:0 | ||
| H: 24.01.2007 17:45 | R: 31.01.2007 15:00 | Sieger: AE Lárissa | ||||
