| 5. Spieltag | 05.04.2025 | JK Narva Trans | - | FCI Levadia | 0:1 | ||||
| 6. Spieltag | 08.04.2025 | FCI Levadia | - | FC Kuressaare | 2:1 | ||||
| 7. Spieltag | 12.04.2025 | FCI Levadia | - | FC Flora | 0:0 | ||||
| 8. Spieltag | 19.04.2025 | JK Tallinna Kalev | - | FCI Levadia | 0:9 |  |
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| 9. Spieltag | 23.04.2025 | Paide Linnameeskond | - | FCI Levadia | 2:1 | ||||
| 10. Spieltag | 26.04.2025 | FCI Levadia | - | JK Tammeka | 4:0 | ||||
| 11. Spieltag | 04.05.2025 | JK Nõmme Kalju | - | FCI Levadia | 2:0 | ||||
| 12. Spieltag | 11.05.2025 | FCI Levadia | - | Paide Linnameeskond | 2:1 | ||||
| 13. Spieltag | 18.05.2025 | FC Flora | - | FCI Levadia | 1:0 | |
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| 14. Spieltag | 28.05.2025 | FCI Levadia | - | Pärnu JK Vaprus | 2:2 | ||||
| 15. Spieltag | 31.05.2025 | Harju JK | - | FCI Levadia | 0:1 | |
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| 16. Spieltag | 14.06.2025 | FC Kuressaare | - | FCI Levadia | 1:2 | ||||
| 17. Spieltag | 18.06.2025 | FCI Levadia | - | JK Tallinna Kalev | 4:0 | ||||
| 20. Spieltag | 21.06.2025 | FCI Levadia | - | JK Nõmme Kalju | 3:1 |
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