| 1. Runde | 31.08.2006 | Colo-Colo | - | Huachipato | 5:3 i.E. | ||||
| 2. Runde | 12.09.2006 | Coronel Bolognesi | - | Colo-Colo | 2:1 | ||||
| 2. Runde | 19.09.2006 | Colo-Colo | - | Coronel Bolognesi | 1:0 | ||||
| Achtelfinale | 04.10.2006 | LD Alajuelense | - | Colo-Colo | 0:4 | ||||
| Achtelfinale | 10.10.2006 | Colo-Colo | - | LD Alajuelense | 7:2 | ||||
| Viertelfinale | 19.10.2006 | Colo-Colo | - | Gimnasia de La Plata | 4:1 | ||||
| Viertelfinale | 26.10.2006 | Gimnasia de La Plata | - | Colo-Colo | 0:2 |  |
|||
| Halbfinale | 16.11.2006 | Colo-Colo | - | Deportivo Toluca | 2:1 | ||||
| Halbfinale | 21.11.2006 | Deportivo Toluca | - | Colo-Colo | 0:2 | ||||
| Finale | 30.11.2006 | CF Pachuca | - | Colo-Colo | 1:1 | ||||
| Finale | 13.12.2006 | Colo-Colo | - | CF Pachuca | 1:2 |
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