| 21. Spieltag | 04.02.2017 | 1. FSV Mainz 05 II | - | SC Paderborn 07 | 0:1 | ||||
| 22. Spieltag | 10.02.2017 | VfL Osnabrück | - | 1. FSV Mainz 05 II | 1:2 |  |
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| 23. Spieltag | 17.02.2017 | 1. FSV Mainz 05 II | - | MSV Duisburg | 0:2 | ||||
| 25. Spieltag | 04.03.2017 | 1. FC Magdeburg | - | 1. FSV Mainz 05 II | 1:2 | ||||
| 26. Spieltag | 11.03.2017 | 1. FSV Mainz 05 II | - | Werder Bremen II | 0:1 | ||||
| 27. Spieltag | 15.03.2017 | SV Wehen Wiesbaden | - | 1. FSV Mainz 05 II | 0:2 |  |
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| 28. Spieltag | 18.03.2017 | 1. FSV Mainz 05 II | - | Holstein Kiel | 0:3 | |
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| 29. Spieltag | 25.03.2017 | Rot-Weiß Erfurt | - | 1. FSV Mainz 05 II | 0:0 | ||||
| 30. Spieltag | 31.03.2017 | 1. FSV Mainz 05 II | - | Chemnitzer FC | 0:1 | ||||
| 31. Spieltag | 04.04.2017 | Jahn Regensburg | - | 1. FSV Mainz 05 II | 2:1 | ||||
| 32. Spieltag | 09.04.2017 | 1. FSV Mainz 05 II | - | Hansa Rostock | 2:4 | ||||
| 34. Spieltag | 22.04.2017 | 1. FSV Mainz 05 II | - | Hallescher FC | 3:2 | |
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| 35. Spieltag | 29.04.2017 | FSV Frankfurt | - | 1. FSV Mainz 05 II | 1:2 | |
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| 36. Spieltag | 06.05.2017 | 1. FSV Mainz 05 II | - | VfR Aalen | 2:0 | |
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| 37. Spieltag | 13.05.2017 | Sportfreunde Lotte | - | 1. FSV Mainz 05 II | 3:3 | |
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Bosnien-Herzegowina
