| 21. Spieltag | 23.07.2011 | Paide Linnameeskond | - | FC Flora | 1:4 |  |
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| 22. Spieltag | 30.07.2011 | FC Flora | - | Ajax Lasnamäe | 13:1 | |
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| 28. Spieltag | 13.09.2011 | FC Flora | - | JK Nõmme Kalju | 1:0 | |
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| 29. Spieltag | 17.09.2011 | JK Tammeka | - | FC Flora | 1:4 | |
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| 30. Spieltag | 24.09.2011 | FC Flora | - | FC Levadia | 3:0 | |
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| 33. Spieltag | 15.10.2011 | Ajax Lasnamäe | - | FC Flora | 0:11 | |
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| 36. Spieltag | 05.11.2011 | FC Viljandi | - | FC Flora | 2:4 | |
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Estland