| 25. Spieltag | 08.03.2017 | Baltika Kaliningrad | - | Volgar Astrakhan | 1:0 |  |
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| 26. Spieltag | 12.03.2017 | Spartak Nalchik | - | Baltika Kaliningrad | 0:0 | ||||
| 27. Spieltag | 19.03.2017 | Baltika Kaliningrad | - | Luch-Energiya Vladivostok | 0:0 | ||||
| 29. Spieltag | 01.04.2017 | Baltika Kaliningrad | - | FK Tosno | 0:2 | ||||
| 30. Spieltag | 07.04.2017 | FK Tambov | - | Baltika Kaliningrad | 0:1 | |
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| 31. Spieltag | 12.04.2017 | Baltika Kaliningrad | - | SKA-Khabarovsk | 0:0 | ||||
| 32. Spieltag | 17.04.2017 | FK Khimki | - | Baltika Kaliningrad | 1:0 | ||||
| 33. Spieltag | 23.04.2017 | Baltika Kaliningrad | - | Sibir Novosibirsk | 1:1 | ||||
| 34. Spieltag | 29.04.2017 | Mordovia Saransk | - | Baltika Kaliningrad | 0:1 | ||||
| 35. Spieltag | 06.05.2017 | Baltika Kaliningrad | - | Kuban Krasnodar (1928-2018) | 0:1 | ||||
| 36. Spieltag | 10.05.2017 | Fakel Voronezh | - | Baltika Kaliningrad | 1:2 | |
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| 37. Spieltag | 14.05.2017 | Baltika Kaliningrad | - | Sokol Saratov | 1:0 |  |
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