| 4. Spieltag | 23.09.2012 | Aris Saloniki | - | AO Kerkyra | 1:0 | ||||
| 5. Spieltag | 29.09.2012 | AO Kerkyra | - | OFI Heraklion | 2:1 |  |
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| 6. Spieltag | 06.10.2012 | AEK Athen | - | AO Kerkyra | 1:1 | |
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| 8. Spieltag | 27.10.2012 | AO Kerkyra | - | PAOK Saloniki | 0:0 | ||||
| 9. Spieltag | 03.11.2012 | Platanias Chanion | - | AO Kerkyra | 1:1 | ||||
| 10. Spieltag | 12.11.2012 | AO Kerkyra | - | Panathinaikos | 0:0 | ||||
| 11. Spieltag | 17.11.2012 | Olympiakos Piraeus | - | AO Kerkyra | 2:0 | ||||
| 12. Spieltag | 25.11.2012 | AO Kerkyra | - | Veria FC | 1:1 |  |
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| 13. Spieltag | 02.12.2012 | Levadiakos | - | AO Kerkyra | 2:0 | ||||
| 17. Spieltag | 14.01.2013 | AO Kerkyra | - | Asteras Tripolis | 0:1 | |
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| 19. Spieltag | 28.01.2013 | AO Kerkyra | - | Aris Saloniki | 2:2 | ||||
| 20. Spieltag | 03.02.2013 | OFI Heraklion | - | AO Kerkyra | 2:0 | ||||
| 21. Spieltag | 10.02.2013 | AO Kerkyra | - | AEK Athen | 0:1 | |
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| 22. Spieltag | 16.02.2013 | AO Kerkyra | - | Panionios GSS | 2:1 | ||||
| 23. Spieltag | 23.02.2013 | PAOK Saloniki | - | AO Kerkyra | 3:1 | ||||
| 24. Spieltag | 02.03.2013 | AO Kerkyra | - | Platanias Chanion | 2:1 | ||||
| 27. Spieltag | 31.03.2013 | Veria FC | - | AO Kerkyra | 2:0 |
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