| 26. Spieltag | 17.09.2016 | Vasco da Gama - RJ | - | Joinville - SC | 2:0 | ||||
| 27. Spieltag | 24.09.2016 | Joinville - SC | - | Avaí - SC | 0:1 | ||||
| 28. Spieltag | 28.09.2016 | Atlético Goianiense | - | Joinville - SC | 1:1 |  |
|||
| 29. Spieltag | 05.10.2016 | Ceará - CE | - | Joinville - SC | 2:1 | ||||
| 30. Spieltag | 08.10.2016 | Joinville - SC | - | Paysandu - PA | 0:0 | ||||
| 31. Spieltag | 15.10.2016 | Joinville - SC | - | Paraná Clube | 1:0 | ||||
| 32. Spieltag | 23.10.2016 | CR Brasil - AL | - | Joinville - SC | 2:1 | ||||
| 34. Spieltag | 05.11.2016 | Sampaio Corrêa - MA | - | Joinville - SC | 1:2 | ||||
| 35. Spieltag | 09.11.2016 | Joinville - SC | - | CA Bragantino | 1:1 |
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