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| # | Mannschaft | Sp. | S. | U. | N. | Tore | Dif. | Pk. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
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1. FC Lok Leipzig | 11 | 9 | 2 | 0 | 33:3 | 30 | 29 |
| 2 |
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Inter Leipzig | 11 | 7 | 3 | 1 | 31:11 | 20 | 24 |
| 3 |
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FC Carl Zeiss Jena II | 12 | 7 | 2 | 3 | 32:14 | 18 | 23 |
| 4 |
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SSV Markranstädt | 12 | 6 | 4 | 2 | 22:9 | 13 | 22 |
| 5 |
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VFC Plauen | 11 | 6 | 3 | 2 | 29:14 | 15 | 21 |
| 6 |
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Energie Cottbus II | 11 | 6 | 2 | 3 | 31:21 | 10 | 20 |
| 7 |
|
Bischofswerdaer FV | 10 | 6 | 2 | 2 | 22:14 | 8 | 20 |
| 8 |
|
FSV Barleben | 12 | 6 | 2 | 4 | 23:16 | 7 | 20 |
| 9 |
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VfL Halle 96 | 12 | 5 | 3 | 4 | 22:17 | 5 | 18 |
| 10 |
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FC Einheit Rudolstadt | 11 | 5 | 2 | 4 | 16:12 | 4 | 17 |
| 11 |
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Rot-Weiß Erfurt II | 11 | 3 | 4 | 4 | 18:15 | 3 | 13 |
| 12 |
|
Askania Bernburg | 10 | 4 | 1 | 5 | 14:12 | 2 | 13 |
| 13 |
|
SV SCHOTT Jena | 9 | 4 | 1 | 4 | 18:26 | -8 | 13 |
| 14 |
|
Union Sandersdorf | 11 | 3 | 3 | 5 | 17:22 | -5 | 12 |
| 15 |
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BSG Wismut Gera | 11 | 3 | 2 | 6 | 14:19 | -5 | 11 |
| 16 |
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FC Eisenach | 11 | 2 | 1 | 8 | 7:31 | -24 | 7 |
| Aufstieg | |
| Abstieg |
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# Rot-Weiß Erfurt II und Energie Cottbus II wurden zum Saisonende zurückgezogen. Dadurch verringerte sich die Zahl der sportlichen Absteiger. # Der FC Eisenach beantragte für die Saison 2016/2017 keine Oberligalizenz |
