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| # | Mannschaft | Sp. | S. | U. | N. | Tore | Dif. | Pk. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
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1. FC Lok Leipzig | 6 | 5 | 1 | 0 | 17:4 | 13 | 16 |
| 2 |
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Union Sandersdorf | 7 | 5 | 1 | 1 | 16:5 | 11 | 16 |
| 3 |
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Bischofswerdaer FV | 7 | 5 | 1 | 1 | 14:5 | 9 | 16 |
| 4 |
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FC Einheit Rudolstadt | 7 | 4 | 3 | 0 | 14:6 | 8 | 15 |
| 5 |
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Inter Leipzig | 7 | 5 | 0 | 2 | 14:9 | 5 | 15 |
| 6 |
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Energie Cottbus II | 8 | 4 | 0 | 4 | 12:15 | -3 | 12 |
| 7 |
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VfL Halle 96 | 7 | 3 | 1 | 3 | 15:9 | 6 | 10 |
| 8 |
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FC Carl Zeiss Jena II | 7 | 3 | 1 | 3 | 17:14 | 3 | 10 |
| 9 |
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SSV Markranstädt | 7 | 3 | 1 | 3 | 12:14 | -2 | 10 |
| 10 |
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Rot-Weiß Erfurt II | 7 | 2 | 2 | 3 | 8:12 | -4 | 8 |
| 11 |
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SV SCHOTT Jena | 8 | 2 | 1 | 5 | 9:18 | -9 | 7 |
| 12 |
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FSV Barleben | 6 | 1 | 1 | 4 | 7:14 | -7 | 4 |
| 13 |
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Askania Bernburg | 7 | 0 | 3 | 4 | 6:15 | -9 | 3 |
| 14 |
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BSG Wismut Gera | 7 | 0 | 2 | 5 | 9:22 | -13 | 2 |
| 15 |
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VFC Plauen | 7 | 0 | 2 | 5 | 4:28 | -24 | 2 |
| 16 |
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FC Eisenach | 7 | 0 | 1 | 6 | 5:22 | -17 | 1 |
| Aufstieg | |
| Abstieg |
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# Rot-Weiß Erfurt II und Energie Cottbus II wurden zum Saisonende zurückgezogen. Dadurch verringerte sich die Zahl der sportlichen Absteiger. # Der FC Eisenach beantragte für die Saison 2016/2017 keine Oberligalizenz |
