| 1. Spieltag | 05.08.2012 | MSV Duisburg | - | VfR Aalen | 1:4 | ||||
| 2. Spieltag | 12.08.2012 | Jahn Regensburg | - | MSV Duisburg | 2:0 | ||||
| 3. Spieltag | 25.08.2012 | MSV Duisburg | - | Dynamo Dresden | 1:3 | ||||
| 9. Spieltag | 06.10.2012 | Energie Cottbus | - | MSV Duisburg | 0:1 | ||||
| 10. Spieltag | 19.10.2012 | MSV Duisburg | - | FC Ingolstadt 04 | 0:2 | ||||
| 11. Spieltag | 27.10.2012 | SV Sandhausen | - | MSV Duisburg | 0:2 | ||||
| 12. Spieltag | 03.11.2012 | MSV Duisburg | - | FSV Frankfurt | 1:2 | ||||
| 13. Spieltag | 09.11.2012 | 1. FC Köln | - | MSV Duisburg | 0:0 | ||||
| 14. Spieltag | 18.11.2012 | MSV Duisburg | - | Erzgebirge Aue | 2:1 | ||||
| 15. Spieltag | 25.11.2012 | FC St. Pauli | - | MSV Duisburg | 4:1 |  |
|||
| 17. Spieltag | 02.12.2012 | SC Paderborn 07 | - | MSV Duisburg | 0:2 | ||||
| 18. Spieltag | 07.12.2012 | VfR Aalen | - | MSV Duisburg | 0:1 | ||||
| 19. Spieltag | 16.12.2012 | MSV Duisburg | - | Jahn Regensburg | 4:2 |
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