| 3. Spieltag | 29.07.2015 | VfB Lübeck | - | FC St. Pauli II | 2:0 |  |
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| 2. Spieltag | 01.08.2015 | FC St. Pauli II | - | Schwarz-Weiß Rehden | 1:1 | ||||
| 4. Spieltag | 16.08.2015 | FC St. Pauli II | - | VfB Oldenburg | 2:3 | ||||
| 6. Spieltag | 29.08.2015 | FC St. Pauli II | - | Goslarer SC | 3:2 | ||||
| 7. Spieltag | 06.09.2015 | TSV Schilksee | - | FC St. Pauli II | 1:2 | |
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| 8. Spieltag | 12.09.2015 | FC St. Pauli II | - | VfL Wolfsburg II | 0:3 | ||||
| 9. Spieltag | 20.09.2015 | BV Cloppenburg | - | FC St. Pauli II | 1:2 | |
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| 11. Spieltag | 02.10.2015 | SV Drochtersen/Assel | - | FC St. Pauli II | 1:1 | |
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| 12. Spieltag | 10.10.2015 | FC St. Pauli II | - | Eintracht Norderstedt | 0:2 | |
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| 15. Spieltag | 30.10.2015 | Eintracht Braunschweig II | - | FC St. Pauli II | 3:1 | ||||
| 17. Spieltag | 02.12.2015 | TSV Havelse | - | FC St. Pauli II | 0:2 | ||||
| 18. Spieltag | 30.01.2016 | FC St. Pauli II | - | VfV Hildesheim | 2:2 | ||||
| 23. Spieltag | 27.02.2016 | Goslarer SC | - | FC St. Pauli II | 3:0 | ||||
| 24. Spieltag | 04.03.2016 | FC St. Pauli II | - | TSV Schilksee | 3:1 | |
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| 22. Spieltag | 09.03.2016 | FC St. Pauli II | - | Lüneburger SK Hansa | 0:2 | ||||
| 26. Spieltag | 18.03.2016 | FC St. Pauli II | - | BV Cloppenburg | 1:0 |
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