| 20. Spieltag | 28.02.2004 | 1. FC Schweinfurt 05 | - | Sportfreunde Siegen | 5:1 | ||||
| 21. Spieltag | 06.03.2004 | Stuttgarter Kickers | - | 1. FC Schweinfurt 05 | 3:2 |  |
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| 22. Spieltag | 13.03.2004 | 1. FC Schweinfurt 05 | - | 1. FC Kaiserslautern II | 3:1 | ||||
| 23. Spieltag | 19.03.2004 | Kickers Offenbach | - | 1. FC Schweinfurt 05 | 0:5 | |
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| 24. Spieltag | 27.03.2004 | 1. FC Schweinfurt 05 | - | 1. FC Eschborn | 2:2 | ||||
| 26. Spieltag | 10.04.2004 | 1. FC Schweinfurt 05 | - | FC Augsburg | 2:2 | ||||
| 27. Spieltag | 17.04.2004 | TSG Hoffenheim | - | 1. FC Schweinfurt 05 | 4:3 | |
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| 28. Spieltag | 24.04.2004 | 1. FC Schweinfurt 05 | - | SC Pfullendorf | 1:0 |  |
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| 29. Spieltag | 30.04.2004 | VfB Stuttgart II | - | 1. FC Schweinfurt 05 | 2:0 | ||||
| 30. Spieltag | 08.05.2004 | 1. FC Schweinfurt 05 | - | 1. FSV Mainz 05 II | 1:0 | ||||
| 31. Spieltag | 15.05.2004 | SV Wehen-Taunusstein | - | 1. FC Schweinfurt 05 | 1:1 | |
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| 32. Spieltag | 22.05.2004 | 1. FC Schweinfurt 05 | - | Rot-Weiß Erfurt | 1:1 | |
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| 33. Spieltag | 29.05.2004 | 1. FC Schweinfurt 05 | - | 1. SC Feucht | 2:5 | ||||
| 34. Spieltag | 05.06.2004 | 1. FC Saarbrücken | - | 1. FC Schweinfurt 05 | 2:1 | |
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