| 2. Spieltag | 30.07.2016 | FC Winterthur | - | FC Aarau | 1:2 |  |
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| 3. Spieltag | 08.08.2016 | FC Aarau | - | Servette FC | 2:0 | ||||
| 4. Spieltag | 11.08.2016 | FC Wil 1900 | - | FC Aarau | 0:0 | ||||
| 5. Spieltag | 20.08.2016 | FC Aarau | - | FC Schaffhausen | 3:2 |  |
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| 7. Spieltag | 10.09.2016 | FC Aarau | - | FC Le Mont | 2:1 | ||||
| 8. Spieltag | 21.09.2016 | FC Wohlen | - | FC Aarau | 1:4 | ||||
| 9. Spieltag | 25.09.2016 | FC Aarau | - | FC Zürich | 1:1 | ||||
| 10. Spieltag | 02.10.2016 | Servette FC | - | FC Aarau | 1:0 | |
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| 11. Spieltag | 16.10.2016 | FC Aarau | - | FC Wil 1900 | 0:1 | |
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| 12. Spieltag | 22.10.2016 | FC Chiasso | - | FC Aarau | 3:1 |  |
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| 14. Spieltag | 06.11.2016 | FC Zürich | - | FC Aarau | 6:3 | ||||
| 15. Spieltag | 21.11.2016 | FC Schaffhausen | - | FC Aarau | 2:3 | ||||
| 16. Spieltag | 26.11.2016 | FC Aarau | - | Neuchâtel Xamax FCS | 2:3 | |
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