| 1. Spieltag | 20.08.2016 | Levante UD B | - | Atlético Baleares | 0:1 | ||||
| 14. Spieltag | 13.11.2016 | Atlético Baleares | - | Espanyol Barcelona B | 0:0 |  |
|||
| 15. Spieltag | 20.11.2016 | CD Ebro | - | Atlético Baleares | 0:0 | ||||
| 16. Spieltag | 27.11.2016 | Atlético Baleares | - | Atlético Saguntino | 1:1 | ||||
| 17. Spieltag | 04.12.2016 | Hércules CF | - | Atlético Baleares | 2:0 | ||||
| 18. Spieltag | 11.12.2016 | Atlético Baleares | - | Villarreal CF B | 2:2 | ||||
| 19. Spieltag | 18.12.2016 | CD Alcoyano | - | Atlético Baleares | 1:1 | ||||
| 20. Spieltag | 08.01.2017 | Atlético Baleares | - | Levante UD B | 1:1 | ||||
| 21. Spieltag | 14.01.2017 | RCD Mallorca B | - | Atlético Baleares | 0:0 | ||||
| 22. Spieltag | 22.01.2017 | Atlético Baleares | - | UE Cornellà | 1:0 | ||||
| 23. Spieltag | 29.01.2017 | CF Gavà | - | Atlético Baleares | 1:2 | ||||
| 26. Spieltag | 19.02.2017 | Atlético Baleares | - | UE Llagostera | 0:0 | ||||
| 28. Spieltag | 05.03.2017 | Atlético Baleares | - | CD Eldense | 5:0 |  |
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| 31. Spieltag | 26.03.2017 | CE L'Hospitalet | - | Atlético Baleares | 0:4 | ||||
| 32. Spieltag | 02.04.2017 | Atlético Baleares | - | AE Prat | 1:0 | ||||
| 35. Spieltag | 23.04.2017 | Atlético Saguntino | - | Atlético Baleares | 0:0 | |
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