| 3. Spieltag | 18.08.2012 | 1. FSV Mainz 05 II | - | SC Pfullendorf | 2:4 | ||||
| 4. Spieltag | 21.08.2012 | SC Freiburg II | - | 1. FSV Mainz 05 II | 1:1 |  |
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| 5. Spieltag | 25.08.2012 | 1. FC Eschborn | - | 1. FSV Mainz 05 II | 2:1 | |
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| 6. Spieltag | 01.09.2012 | 1. FSV Mainz 05 II | - | FC 08 Homburg | 1:3 | ||||
| 7. Spieltag | 04.09.2012 | Eintracht Frankfurt II | - | 1. FSV Mainz 05 II | 0:1 | ||||
| 8. Spieltag | 11.09.2012 | 1. FSV Mainz 05 II | - | FSV Frankfurt II | 2:0 | ||||
| 9. Spieltag | 15.09.2012 | Wormatia Worms | - | 1. FSV Mainz 05 II | 1:4 |  |
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| 10. Spieltag | 23.09.2012 | 1. FSV Mainz 05 II | - | SC 07 Idar-Oberstein | 1:1 | |
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| 14. Spieltag | 20.10.2012 | 1. FSV Mainz 05 II | - | Hessen Kassel | 4:4 | |
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| 23. Spieltag | 24.02.2013 | 1. FSV Mainz 05 II | - | SC Freiburg II | 2:1 |
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