| 1. Spieltag | 13.03.2010 | FK Rostov | - | FK Tom Tomsk | 0:2 |  |
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| 2. Spieltag | 22.03.2010 | FK Tom Tomsk | - | Rubin Kazan | 0:1 | ||||
| 4. Spieltag | 04.04.2010 | FK Tom Tomsk | - | Spartak Moskva | 2:2 | |
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| 5. Spieltag | 10.04.2010 | Dinamo Moskva | - | FK Tom Tomsk | 0:0 | ||||
| 7. Spieltag | 24.04.2010 | Lokomotiv Moskva | - | FK Tom Tomsk | 2:1 | |
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| 8. Spieltag | 02.05.2010 | CSKA Moskva | - | FK Tom Tomsk | 3:1 | ||||
| 9. Spieltag | 06.05.2010 | FK Tom Tomsk | - | Terek Grozny | 2:1 | |
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| 10. Spieltag | 11.05.2010 | FK Saturn | - | FK Tom Tomsk | 1:2 | |
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| 11. Spieltag | 15.05.2010 | FK Tom Tomsk | - | Spartak Nalchik | 1:0 | |
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| 12. Spieltag | 10.07.2010 | FK Amkar Perm | - | FK Tom Tomsk | 2:1 | |
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| 13. Spieltag | 18.07.2010 | FK Tom Tomsk | - | Anzhi Makhachkala | 1:4 | ||||
| 14. Spieltag | 24.07.2010 | Spartak Vladikavkaz | - | FK Tom Tomsk | 2:1 | |
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| 16. Spieltag | 08.08.2010 | Rubin Kazan | - | FK Tom Tomsk | 2:1 | ||||
| 17. Spieltag | 14.08.2010 | FK Tom Tomsk | - | Krylia Sovetov | 1:1 | |
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| 18. Spieltag | 21.08.2010 | Spartak Moskva | - | FK Tom Tomsk | 4:2 | |
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