| 1. Spieltag | 13.08.2006 | Eintracht Nordhorn | - | BV Cloppenburg | 0:1 | ||||
| 2. Spieltag | 20.08.2006 | BV Cloppenburg | - | VfL Osnabrück II | 3:1 | ||||
| 4. Spieltag | 03.09.2006 | BV Cloppenburg | - | VfL 93 Hamburg | 2:0 |  |
|||
| 6. Spieltag | 15.09.2006 | BV Cloppenburg | - | VfR Neumünster | 0:0 |  |
|||
| 9. Spieltag | 13.10.2006 | BV Cloppenburg | - | SV Meppen | 3:0 | ||||
| 10. Spieltag | 20.10.2006 | FC Oberneuland | - | BV Cloppenburg | 2:0 | ||||
| 12. Spieltag | 05.11.2006 | Arminia Hannover | - | BV Cloppenburg | 1:2 | ||||
| 13. Spieltag | 11.11.2006 | BV Cloppenburg | - | VfL Wolfsburg II | 0:3 | ||||
| 14. Spieltag | 19.11.2006 | VSK Osterholz-Scharmbeck | - | BV Cloppenburg | 1:3 | ||||
| 15. Spieltag | 26.11.2006 | BV Cloppenburg | - | SV Henstedt-Rhen | 2:0 | |
|||
| 16. Spieltag | 03.12.2006 | FC St. Pauli II | - | BV Cloppenburg | 0:2 | |
|||
| 17. Spieltag | 08.12.2006 | BV Cloppenburg | - | Holstein Kiel II | 0:3 | ||||
| 18. Spieltag | 15.12.2006 | BV Cloppenburg | - | Eintracht Nordhorn | 1:0 | ||||
| 19. Spieltag | 10.02.2007 | BV Cloppenburg | - | ASV Bergedorf | 2:1 | ||||
| 20. Spieltag | 18.02.2007 | VfL 93 Hamburg | - | BV Cloppenburg | 0:1 | ||||
| 21. Spieltag | 24.02.2007 | BV Cloppenburg | - | Hannover 96 II | 3:0 |
Ukraine