| 16. Spieltag | 07.01.2013 | Skoda Xanthi | - | OFI Heraklion | 3:0 | ||||
| 17. Spieltag | 12.01.2013 | AEK Athen | - | Skoda Xanthi | 1:0 | ||||
| 18. Spieltag | 20.01.2013 | Skoda Xanthi | - | AO Kerkyra | 0:0 | ||||
| 19. Spieltag | 27.01.2013 | PAOK Saloniki | - | Skoda Xanthi | 0:1 | ||||
| 20. Spieltag | 02.02.2013 | Skoda Xanthi | - | Platanias Chanion | 2:0 | ||||
| 21. Spieltag | 10.02.2013 | Panathinaikos | - | Skoda Xanthi | 0:1 | ||||
| 22. Spieltag | 17.02.2013 | Skoda Xanthi | - | Olympiakos Piraeus | 0:2 | ||||
| 25. Spieltag | 10.03.2013 | Skoda Xanthi | - | PAS Giannina | 0:1 | ||||
| 26. Spieltag | 18.03.2013 | Panthrakikos | - | Skoda Xanthi | 0:2 | ||||
| 29. Spieltag | 14.04.2013 | Panionios GSS | - | Skoda Xanthi | 3:3 | ||||
| 30. Spieltag | 21.04.2013 | Skoda Xanthi | - | Aris Saloniki | 0:0 |
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