| 27. Spieltag | 27.02.2021 | Baltika Kaliningrad | - | FK Krasnodar 2 | 2:0 | ||||
| 28. Spieltag | 06.03.2021 | FK Krasnodar 2 | - | Veles Moskva | 2:1 | ||||
| 29. Spieltag | 10.03.2021 | SKA-Khabarovsk | - | FK Krasnodar 2 | 0:0 | ||||
| 30. Spieltag | 14.03.2021 | FK Krasnodar 2 | - | FK Chayka | 1:1 | ||||
| 31. Spieltag | 20.03.2021 | FK Orenburg | - | FK Krasnodar 2 | 1:0 | ||||
| 32. Spieltag | 24.03.2021 | FK Krasnodar 2 | - | Enisey Krasnoyarsk | 0:2 | ||||
| 34. Spieltag | 02.04.2021 | FK Krasnodar 2 | - | FK Chertanovo | 1:0 |  |
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| 35. Spieltag | 07.04.2021 | FK Tom Tomsk | - | FK Krasnodar 2 | 1:1 |  |
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| 36. Spieltag | 11.04.2021 | FK Krasnodar 2 | - | Irtysh Omsk | 2:0 | ||||
| 37. Spieltag | 17.04.2021 | Dinamo Bryansk | - | FK Krasnodar 2 | 2:1 | ||||
| 38. Spieltag | 24.04.2021 | FK Krasnodar 2 | - | FK Neftekhimik | 1:1 | ||||
| 39. Spieltag | 28.04.2021 | Alania Vladikavkaz | - | FK Krasnodar 2 | 3:1 |
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