| 8. Spieltag | 22.09.2012 | Port Vale FC | - | Gillingham FC | 0:2 | ||||
| 9. Spieltag | 29.09.2012 | Gillingham FC | - | Rochdale AFC | 1:2 | ||||
| 10. Spieltag | 02.10.2012 | Northampton Town | - | Gillingham FC | 1:2 | ||||
| 11. Spieltag | 06.10.2012 | Oxford United | - | Gillingham FC | 0:0 |  |
|||
| 12. Spieltag | 13.10.2012 | Gillingham FC | - | Aldershot Town | 4:0 | ||||
| 13. Spieltag | 20.10.2012 | Gillingham FC | - | Burton Albion | 4:1 | ||||
| 14. Spieltag | 23.10.2012 | Torquay United | - | Gillingham FC | 2:1 |
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