| 22. Spieltag | 24.02.2010 | 1. FSV Mainz 05 II | - | VfL Bochum II | 0:0 | ||||
| 20. Spieltag | 02.03.2010 | 1. FSV Mainz 05 II | - | Bor. Mönchengladbach II | 1:2 |  |
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| 23. Spieltag | 05.03.2010 | Bayer Leverkusen II | - | 1. FSV Mainz 05 II | 1:1 | ||||
| 24. Spieltag | 15.03.2010 | 1. FC Kaiserslautern II | - | 1. FSV Mainz 05 II | 1:1 | ||||
| 25. Spieltag | 21.03.2010 | 1. FSV Mainz 05 II | - | FC Schalke 04 II | 1:2 | ||||
| 21. Spieltag | 24.03.2010 | Waldhof Mannheim | - | 1. FSV Mainz 05 II | 3:1 | |
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| 26. Spieltag | 27.03.2010 | 1. FC Saarbrücken | - | 1. FSV Mainz 05 II | 0:0 |  |
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| 27. Spieltag | 03.04.2010 | 1. FSV Mainz 05 II | - | SC Verl | 0:0 | ||||
| 28. Spieltag | 11.04.2010 | Fortuna Düsseldorf II | - | 1. FSV Mainz 05 II | 0:3 | |
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| 29. Spieltag | 17.04.2010 | 1. FSV Mainz 05 II | - | Bonner SC | 0:1 | ||||
| 30. Spieltag | 23.04.2010 | 1. FC Köln II | - | 1. FSV Mainz 05 II | 3:1 | ||||
| 31. Spieltag | 29.04.2010 | 1. FSV Mainz 05 II | - | Wormatia Worms | 4:1 | ||||
| 32. Spieltag | 07.05.2010 | SV 07 Elversberg | - | 1. FSV Mainz 05 II | 2:1 | ||||
| 33. Spieltag | 22.05.2010 | 1. FSV Mainz 05 II | - | Eintracht Trier | 2:0 | |
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| 34. Spieltag | 29.05.2010 | Rot-Weiss Essen | - | 1. FSV Mainz 05 II | 0:0 | |
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