| 20. Spieltag | 27.02.2010 | Bayern Alzenau | - | SpVgg Greuther Fürth II | 2:4 |  |
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| 22. Spieltag | 13.03.2010 | Bayern Alzenau | - | Karlsruher SC II | 0:0 | ||||
| 23. Spieltag | 21.03.2010 | Eintracht Frankfurt II | - | Bayern Alzenau | 1:0 |  |
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| 24. Spieltag | 27.03.2010 | Bayern Alzenau | - | 1. FC Eintracht Bamberg | 1:2 | |
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| 18. Spieltag | 31.03.2010 | Bayern Alzenau | - | SSV Ulm 1846 | 0:3 | |
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| 25. Spieltag | 03.04.2010 | SC Freiburg II | - | Bayern Alzenau | 3:0 | ||||
| 26. Spieltag | 10.04.2010 | SSV Reutlingen | - | Bayern Alzenau | 3:0 | ||||
| 27. Spieltag | 16.04.2010 | Bayern Alzenau | - | Hessen Kassel | 2:1 | |
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| 28. Spieltag | 23.04.2010 | VfR Aalen | - | Bayern Alzenau | 3:0 |  |
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| 31. Spieltag | 12.05.2010 | Bayern Alzenau | - | SV Wehen Wiesbaden II | 1:0 | |
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| 32. Spieltag | 15.05.2010 | SpVgg Weiden | - | Bayern Alzenau | 2:2 | |
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| 34. Spieltag | 29.05.2010 | SV Darmstadt 98 | - | Bayern Alzenau | 3:1 |
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