| 15. Spieltag | 21.11.2009 | 1. FC Eintracht Bamberg | - | TSV 1860 München II | 1:0 | ||||
| 16. Spieltag | 27.11.2009 | TSV 1860 München II | - | Bayern Alzenau | 1:0 |  |
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| 18. Spieltag | 30.03.2010 | Hessen Kassel | - | TSV 1860 München II | 1:1 |  |
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| 25. Spieltag | 03.04.2010 | SV Darmstadt 98 | - | TSV 1860 München II | 2:0 | ||||
| 28. Spieltag | 23.04.2010 | TSV 1860 München II | - | SpVgg Greuther Fürth II | 1:0 | |
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| 29. Spieltag | 30.04.2010 | SC Pfullendorf | - | TSV 1860 München II | 0:1 | ||||
| 30. Spieltag | 07.05.2010 | TSV 1860 München II | - | Karlsruher SC II | 3:2 | ||||
| 31. Spieltag | 12.05.2010 | Eintracht Frankfurt II | - | TSV 1860 München II | 2:0 | ||||
| 32. Spieltag | 16.05.2010 | TSV 1860 München II | - | 1. FC Eintracht Bamberg | 4:0 | ||||
| 33. Spieltag | 22.05.2010 | Bayern Alzenau | - | TSV 1860 München II | 1:3 |
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