| 2. Spieltag | 16.07.2016 | FK Khimki | - | FK Tambov | 0:0 | ||||
| 3. Spieltag | 23.07.2016 | SKA-Khabarovsk | - | FK Khimki | 1:1 | ||||
| 5. Spieltag | 31.07.2016 | FK Khimki | - | Sibir Novosibirsk | 1:1 | ||||
| 6. Spieltag | 06.08.2016 | Mordovia Saransk | - | FK Khimki | 5:0 | ||||
| 9. Spieltag | 21.08.2016 | FK Khimki | - | Sokol Saratov | 0:0 | ||||
| 10. Spieltag | 28.08.2016 | Shinnik Yaroslavl | - | FK Khimki | 2:0 | ||||
| 11. Spieltag | 02.09.2016 | FK Khimki | - | FK Tyumen | 3:2 |  |
|||
| 12. Spieltag | 10.09.2016 | Enisey Krasnoyarsk | - | FK Khimki | 3:0 | ||||
| 26. Spieltag | 12.03.2017 | FK Khimki | - | Fakel Voronezh | 0:0 |
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