| 5. Spieltag | 08.09.2012 | Energie Cottbus [B-Junioren] | - | Holstein Kiel [B-Junioren] | 4:1 | ||||
| 6. Spieltag | 22.09.2012 | Holstein Kiel [B-Junioren] | - | FC St. Pauli [B-Junioren] | 2:1 |  |
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| 10. Spieltag | 13.10.2012 | Holstein Kiel [B-Junioren] | - | Hertha BSC [B-Junioren] | 1:4 | ||||
| 8. Spieltag | 21.10.2012 | Holstein Kiel [B-Junioren] | - | VfL Osnabrück [B-Junioren] | 3:2 | ||||
| 9. Spieltag | 28.10.2012 | VfL Wolfsburg [B-Junioren] | - | Holstein Kiel [B-Junioren] | 3:5 | ||||
| 11. Spieltag | 11.11.2012 | RB Leipzig [B-Junioren] | - | Holstein Kiel [B-Junioren] | 1:0 |  |
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| 19. Spieltag | 02.03.2013 | FC St. Pauli [B-Junioren] | - | Holstein Kiel [B-Junioren] | 0:3 | ||||
| 16. Spieltag | 09.03.2013 | Holstein Kiel [B-Junioren] | - | Eintracht Norderstedt [B-Junioren] | 2:0 | ||||
| 20. Spieltag | 16.03.2013 | Holstein Kiel [B-Junioren] | - | Hannover 96 [B-Junioren] | 2:1 | ||||
| 14. Spieltag | 14.04.2013 | Rot-Weiß Erfurt [B-Junioren] | - | Holstein Kiel [B-Junioren] | 1:3 | ||||
| 22. Spieltag | 21.04.2013 | Hertha BSC [B-Junioren] | - | Holstein Kiel [B-Junioren] | 3:4 |  |
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