| 1. Spieltag | 18.07.2024 | Wacker Burghausen | - | Bayern München II | 0:1 | ||||
| 6. Spieltag | 24.08.2024 | Würzburger Kickers | - | Bayern München II | 1:4 |  |
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| 9. Spieltag | 13.09.2024 | Bayern München II | - | TSV Aubstadt | 2:2 | ||||
| 10. Spieltag | 20.09.2024 | SpVgg Hankofen-Hailing | - | Bayern München II | 2:0 | ||||
| 11. Spieltag | 27.09.2024 | Bayern München II | - | TSV Buchbach | 2:3 | |
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| 12. Spieltag | 03.10.2024 | Eintracht Bamberg | - | Bayern München II | 0:2 | ||||
| 15. Spieltag | 18.10.2024 | Bayern München II | - | FV Illertissen | 3:2 | ||||
| 16. Spieltag | 22.10.2024 | Türkgücü München | - | Bayern München II | 1:1 | ||||
| 17. Spieltag | 25.10.2024 | Bayern München II | - | TSV Schwaben Augsburg | 3:0 | ||||
| 14. Spieltag | 29.10.2024 | Bayern München II | - | SpVgg Greuther Fürth II | 4:0 | ||||
| 18. Spieltag | 02.11.2024 | Bayern München II | - | Wacker Burghausen | 5:2 | |
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| 20. Spieltag | 15.11.2024 | Bayern München II | - | 1. FC Nürnberg II | 4:0 | |
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| 21. Spieltag | 22.11.2024 | SpVgg Bayreuth | - | Bayern München II | 1:1 | ||||
| 22. Spieltag | 30.11.2024 | Viktoria Aschaffenburg | - | Bayern München II | 0:2 | ||||
| 8. Spieltag | 06.12.2024 | FC Augsburg II | - | Bayern München II | 1:3 |
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