| 18. Spieltag | 11.12.2005 | FC Thun | - | FC Schaffhausen | 0:3 | ||||
| 20. Spieltag | 19.02.2006 | FC Thun | - | BSC Young Boys | 1:1 |  |
|||
| 24. Spieltag | 18.03.2006 | FC Thun | - | FC Schaffhausen | 2:1 | ||||
| 25. Spieltag | 22.03.2006 | FC Thun | - | Grasshopper Club Zürich | 0:1 | ||||
| 28. Spieltag | 06.04.2006 | FC Aarau | - | FC Thun | 0:1 | ||||
| 29. Spieltag | 09.04.2006 | FC Thun | - | FC St. Gallen | 3:1 | ||||
| 30. Spieltag | 12.04.2006 | Grasshopper Club Zürich | - | FC Thun | 3:1 | ||||
| 31. Spieltag | 20.04.2006 | FC Schaffhausen | - | FC Thun | 2:3 | ||||
| 32. Spieltag | 23.04.2006 | FC Thun | - | Yverdon Sport FC | 1:0 | ||||
| 33. Spieltag | 29.04.2006 | FC Basel 1893 | - | FC Thun | 2:0 | ||||
| 34. Spieltag | 03.05.2006 | FC Thun | - | FC Zürich | 1:3 | |
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| 35. Spieltag | 07.05.2006 | BSC Young Boys | - | FC Thun | 2:1 | ||||
| 36. Spieltag | 14.05.2006 | FC Thun | - | Neuchâtel Xamax FC | 3:0 |  |
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