| 1. Spieltag | 17.08.2008 | FC Schalke 04 II | - | Preußen Münster | 1:1 | ||||
| 2. Spieltag | 22.08.2008 | Rot-Weiss Essen | - | FC Schalke 04 II | 4:0 | ||||
| 3. Spieltag | 31.08.2008 | FC Schalke 04 II | - | 1. FSV Mainz 05 II | 1:1 | ||||
| 10. Spieltag | 06.09.2008 | Sportfreunde Lotte | - | FC Schalke 04 II | 0:1 | ||||
| 4. Spieltag | 13.09.2008 | 1. FC Kleve | - | FC Schalke 04 II | 3:2 | ||||
| 5. Spieltag | 21.09.2008 | FC Schalke 04 II | - | Bor. Mönchengladbach II | 1:1 | ||||
| 6. Spieltag | 27.09.2008 | Bayer Leverkusen II | - | FC Schalke 04 II | 0:2 | ||||
| 7. Spieltag | 04.10.2008 | FC Schalke 04 II | - | SV 07 Elversberg | 0:0 | ||||
| 8. Spieltag | 17.10.2008 | FSV Oggersheim | - | FC Schalke 04 II | 0:0 | ||||
| 9. Spieltag | 25.10.2008 | FC Schalke 04 II | - | Borussia Dortmund II | 0:2 | ||||
| 13. Spieltag | 15.11.2008 | VfL Bochum II | - | FC Schalke 04 II | 0:3 |  |
|||
| 15. Spieltag | 28.11.2008 | Eintracht Trier | - | FC Schalke 04 II | 1:0 | ||||
| 14. Spieltag | 03.12.2008 | FC Schalke 04 II | - | 1. FC Köln II | 3:3 | |
|||
| 16. Spieltag | 07.12.2008 | FC Schalke 04 II | - | BV Cloppenburg | 1:2 | ||||
| 17. Spieltag | 12.12.2008 | Wormatia Worms | - | FC Schalke 04 II | 0:2 |
Deutschland