| 1. Spieltag | 30.07.2005 | Rot-Weiß Erfurt | - | 1. FC Köln II | 4:3 | ||||
| 18. Spieltag | 19.11.2005 | Hamburger SV II | - | 1. FC Köln II | 0:1 |  |
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| 19. Spieltag | 27.11.2005 | 1. FC Köln II | - | Werder Bremen II | 1:0 | |
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| 20. Spieltag | 03.12.2005 | 1. FC Köln II | - | Rot-Weiß Erfurt | 1:1 | ||||
| 21. Spieltag | 10.12.2005 | Kickers Emden | - | 1. FC Köln II | 3:0 | |
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| 23. Spieltag | 11.02.2006 | Fortuna Düsseldorf | - | 1. FC Köln II | 2:0 | ||||
| 24. Spieltag | 18.02.2006 | 1. FC Köln II | - | Rot-Weiß Oberhausen | 0:1 | ||||
| 25. Spieltag | 25.02.2006 | Wuppertaler SV | - | 1. FC Köln II | 2:0 | ||||
| 34. Spieltag | 29.04.2006 | 1. FC Köln II | - | Rot-Weiss Essen | 1:1 | ||||
| 37. Spieltag | 20.05.2006 | 1. FC Köln II | - | Hamburger SV II | 0:3 | ||||
| 38. Spieltag | 27.05.2006 | Werder Bremen II | - | 1. FC Köln II | 2:2 |  |
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Deutschland