| 2. Spieltag | 03.03.2018 | FC Flora | - | Tulevik Viljandi | 1:0 |  |
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| 3. Spieltag | 09.03.2018 | FC Flora | - | Paide Linnameeskond | 6:0 | ||||
| 4. Spieltag | 14.03.2018 | JK Nõmme Kalju | - | FC Flora | 2:0 | |
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| 6. Spieltag | 01.04.2018 | FC Flora | - | JK Tallinna Kalev | 1:0 | ||||
| 7. Spieltag | 04.04.2018 | FC Kuressaare | - | FC Flora | 0:7 | ||||
| 8. Spieltag | 07.04.2018 | FC Flora | - | JK Narva Trans | 0:0 | ||||
| 9. Spieltag | 14.04.2018 | FCI Levadia | - | FC Flora | 2:1 | ||||
| 10. Spieltag | 21.04.2018 | Tulevik Viljandi | - | FC Flora | 0:6 | ||||
| 11. Spieltag | 28.04.2018 | Paide Linnameeskond | - | FC Flora | 0:2 | ||||
| 12. Spieltag | 02.05.2018 | FC Flora | - | JK Nõmme Kalju | 3:3 | ||||
| 14. Spieltag | 12.05.2018 | Pärnu JK Vaprus | - | FC Flora | 1:8 |  |
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| 15. Spieltag | 16.05.2018 | FC Flora | - | FC Kuressaare | 2:1 | ||||
| 23. Spieltag | 19.08.2018 | FC Flora | - | JK Tallinna Kalev | 3:1 | ||||
| 24. Spieltag | 24.08.2018 | FC Flora | - | JK Tammeka | 5:0 | ||||
| 29. Spieltag | 22.09.2018 | FC Flora | - | Pärnu JK Vaprus | 3:0 | ||||
| 33. Spieltag | 20.10.2018 | JK Narva Trans | - | FC Flora | 1:2 | |
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| 35. Spieltag | 03.11.2018 | Tulevik Viljandi | - | FC Flora | 1:3 |
Estland