| 1. Spieltag | 04.03.2017 | FC Flora | - | FC Levadia | 1:1 | ||||
| 2. Spieltag | 10.03.2017 | JK Nõmme Kalju | - | FC Flora | 1:1 |  |
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| 4. Spieltag | 01.04.2017 | FC Flora | - | JK Tammeka | 4:0 |  |
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| 5. Spieltag | 08.04.2017 | FC Flora | - | JK Sillamäe Kalev | 2:0 | ||||
| 6. Spieltag | 14.04.2017 | FC Flora | - | Paide Linnameeskond | 3:0 | ||||
| 15. Spieltag | 03.06.2017 | JK Tammeka | - | FC Flora | 0:2 | ||||
| 16. Spieltag | 16.06.2017 | Pärnu JK Vaprus | - | FC Flora | 0:10 |  |
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| 17. Spieltag | 19.06.2017 | FC Flora | - | JK Nõmme Kalju | 2:0 | ||||
| 18. Spieltag | 09.07.2017 | FC Levadia | - | FC Flora | 0:0 | |
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| 19. Spieltag | 14.07.2017 | FC Flora | - | FC Levadia | 3:3 | ||||
| 20. Spieltag | 22.07.2017 | JK Tammeka | - | FC Flora | 2:3 | ||||
| 21. Spieltag | 29.07.2017 | FC Flora | - | JK Narva Trans | 1:0 | ||||
| 22. Spieltag | 05.08.2017 | Pärnu JK Vaprus | - | FC Flora | 1:8 | ||||
| 23. Spieltag | 11.08.2017 | FC Flora | - | Tulevik Viljandi | 3:2 | ||||
| 24. Spieltag | 15.08.2017 | JK Sillamäe Kalev | - | FC Flora | 0:3 | ||||
| 25. Spieltag | 18.08.2017 | FC Flora | - | Paide Linnameeskond | 3:0 |
Estland